Depois de anos de paz no mundo ninja, uma reviravolta chocante muda completamente a vida de Boruto Uzumaki. Forçado a fugir e considerado um inimigo perigoso, Boruto retorna mais forte e determinado após o timeskip em Boruto: Two Blue Vortex. Enquanto novas ameaças poderosas surgem e o destino da Vila da Folha fica em risco, Boruto precisa enfrentar inimigos extremamente perigosos enquanto descobre a verdade por trás dos misteriosos poderes divinos que estão mudando o mundo.

Boruto: Two Blue Vortex apresenta batalhas ninja intensas, uma história mais sombria e uma grande evolução dos personagens em comparação com a série original. Com habilidades aprimoradas, rivalidades emocionantes e conflitos de alto risco, o mangá leva Boruto, Kawaki, Sarada e a nova geração de shinobis para uma nova era perigosa onde destino e sobrevivência entram em colisão.